Короче, решил еще раз попробовать юзать gnome-shell
Все опять в переключатели клавиатуры уперлось, тут не работает shift_caps_switch, может это связано с тем что они с xkb на ibus переходили?

Как сделать в ibus то же самое?

Не было печали, апдейтов накачали.
В gnome-flashback 3.18 обновили плагин input-sources, и у меня снова перестали работать раскладки через setxkbmap (я их юзаю потому что только там есть caps -> first, shift+caps -> last, самый удобный вариант).

К счастью, его можно выключить:
https://mail.gnome.org/arch...ctober/msg00005.html

dconf write /org/gnome/gnome-flashback/input-sources false

(люблю опенсорс)